Вътрешната структура на йонообменната смола се състои от три части, които са:
1, полимерен скелет
Състои се от омрежен висок полимер;
2. Йонообменни групи
Той е прикрепен към полимерния скелет и има или йонни функционални групи с обменни йони (наречени противойони), или полярни нейонни функционални групи;
3. Дупки
Това е пора в полимерната структура (гелова пора) и пора между полимерната структура (капилярна пора), която съществува както в сухи, така и в мокри йонообменни смоли.
В омрежената структура на полимерната матрица (скелет) много обменни групи са химически свързани и тези обменни групи също са съставени от две части: фиксирана част и активна част. Фиксираната част от обменната група е свързана със субстрата на полимера и не може да се движи свободно, така че се нарича фиксиран йон. Активната част на обменната група е йонът с обратен символ на фиксирания йон, който се нарича противойон или обменен йон. Противоположните йони могат да се дисоциират в свободно движещи се йони в разтвора и да се обменят с други противойони със същия символ при определени условия.
